在细胞应激反应中,RNA解旋酶Ded1会调节蛋白质翻译和应激颗粒形成过程
文章背景简介
在各种不同类型的应激情况中,有一个共同特征是应激颗粒(SG)的形成,SG是一种由RNA和蛋白质组成的非膜细胞器,通常包括具有促进液-液相分离的低复杂性固有无序区域(IDR)的蛋白质。尽管SG与应激条件和翻译抑制密切相关,但SG的功能尚不清楚。
Ded1是酿酒酵母中的一种翻译因子,它在翻译起始中发挥着多种不同作用。Ded1(同源物DDX3X)是DEAD盒RNA解旋酶蛋白家族的成员,该家族利用ATP改变RNA-RNA和RNA-蛋白相互作用,对许多基因表达过程至关重要。Ded1及其直系同源物也与应激条件下的翻译抑制有关,尤其与SG相关。Ded1和DDX3X是SG的主要蛋白组分,可影响SG组装。单独过表达DED1可在细胞中诱导SG样病灶。
前期发现Ded1在TOR通路下游的翻译反应中发挥着重要作用,TOR通路是细胞生长和应激的核心整合因子。具体而言,当TOR通路下调时,需要Ded1进行有效的翻译抑制和生长抑制。值得注意的事,Ded1的低复杂结构域C端是这些反应所必需的,这促进了其结合伴侣eIF4G1的降解。因此,在这些条件下,Ded1可能会重塑翻译复合物,导致eIF4G1的解离和降解,从而减少应激期间的批量翻译。然而,目前尚不清楚Ded1在SG动力学中的作用是如何影响该模型的,特别是在不同的细胞应激中。
为了探究这些问题,美国亚利桑那大学PeymanP.Aryanpur等人在两种不同条件下分析了依赖Ded1的翻译调节机制,并于2022年在芦MolecularandCellularBiology禄杂志(IF=5.3,Q2)发表了题为TheRNAHelicaseDed1RegulatesTranslationandGranuleFormationduringMultiplePhasesofCellularStressResponses的文章。
所用到的主要方法
1、酵母菌株构建
2、生长测定
3、荧光显微镜
4、菌株在H2O2条件下的生长及活力的测定
文章主要内容摘要
1.DED1生长抑制取决于蛋白质水平和C末端区域,但不依赖于解旋酶结构域。
2.Ded1诱导的SG形成依赖于C末端区域,但不依赖于解旋酶结构域。
3.Ded1与eIF4G1的相互作用对DED1过表达表型有中等影响。
4.Ded1在氧化应激期间促进细胞存活和生长。
5.Ded1在氧化应激期间SG动力学中的作用。
6.Ded1与eIF4G1的相互作用影响其在氧化应激中的作用。
7.Ded1在适应氧化应激期间促进翻译的恢复。
原文标题:在细胞应激反应中,RNA解旋酶Ded1会调节蛋白质翻译和应激颗粒形成过程
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